Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q8C5C9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q8C5C9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q8C5C9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8C5C9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8C5C9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C5C9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C5C9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms