Protein–RNA interactions for Protein: Q8C503

Sit1, Signaling threshold-regulating transmembrane adapter 1, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sit1Q8C503 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sit1Q8C503 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sit1Q8C503 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sit1Q8C503 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sit1Q8C503 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sit1Q8C503 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sit1Q8C503 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sit1Q8C503 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sit1Q8C503 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sit1Q8C503 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sit1Q8C503 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sit1Q8C503 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sit1Q8C503 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sit1Q8C503 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sit1Q8C503 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sit1Q8C503 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sit1Q8C503 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sit1Q8C503 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sit1Q8C503 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sit1Q8C503 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms