Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3M9

Uncharacterized protein C2orf80 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C3M9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3M9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3M9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3M9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3M9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3M9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3M9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q8C3M9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q8C3M9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms