Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp38Q8BW70 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Usp38Q8BW70 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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