Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms