Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem260Q8BMD6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem260Q8BMD6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms