Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms