Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms