Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Lrrtm2Q8BGA3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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