Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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ChfrQ810L3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChfrQ810L3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChfrQ810L3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChfrQ810L3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChfrQ810L3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChfrQ810L3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChfrQ810L3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChfrQ810L3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChfrQ810L3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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ChfrQ810L3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ChfrQ810L3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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ChfrQ810L3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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ChfrQ810L3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChfrQ810L3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChfrQ810L3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChfrQ810L3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChfrQ810L3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChfrQ810L3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChfrQ810L3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChfrQ810L3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ChfrQ810L3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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ChfrQ810L3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChfrQ810L3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChfrQ810L3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChfrQ810L3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChfrQ810L3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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ChfrQ810L3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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ChfrQ810L3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChfrQ810L3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChfrQ810L3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChfrQ810L3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChfrQ810L3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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ChfrQ810L3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ChfrQ810L3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ChfrQ810L3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ChfrQ810L3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
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ChfrQ810L3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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ChfrQ810L3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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