Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU5

Ccdc181, Coiled-coil domain-containing protein 181, mousemouse

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc181Q80ZU5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ccdc181Q80ZU5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc181Q80ZU5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc181Q80ZU5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc181Q80ZU5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc181Q80ZU5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc181Q80ZU5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc181Q80ZU5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc181Q80ZU5 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc181Q80ZU5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc181Q80ZU5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc181Q80ZU5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Ccdc181Q80ZU5 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc181Q80ZU5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc181Q80ZU5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ccdc181Q80ZU5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ccdc181Q80ZU5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc181Q80ZU5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc181Q80ZU5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc181Q80ZU5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc181Q80ZU5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc181Q80ZU5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc181Q80ZU5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc181Q80ZU5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc181Q80ZU5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc181Q80ZU5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc181Q80ZU5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc181Q80ZU5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ccdc181Q80ZU5 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc181Q80ZU5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ccdc181Q80ZU5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc181Q80ZU5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ccdc181Q80ZU5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc181Q80ZU5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ccdc181Q80ZU5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ccdc181Q80ZU5 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc181Q80ZU5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc181Q80ZU5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc181Q80ZU5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc181Q80ZU5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc181Q80ZU5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc181Q80ZU5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc181Q80ZU5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc181Q80ZU5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc181Q80ZU5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc181Q80ZU5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc181Q80ZU5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc181Q80ZU5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc181Q80ZU5 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc181Q80ZU5 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc181Q80ZU5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc181Q80ZU5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc181Q80ZU5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc181Q80ZU5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc181Q80ZU5 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc181Q80ZU5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms