Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Pcsk9Q80W65 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Pcsk9Q80W65 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Pcsk9Q80W65 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Pcsk9Q80W65 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcsk9Q80W65 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Pcsk9Q80W65 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Pcsk9Q80W65 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Pcsk9Q80W65 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Pcsk9Q80W65 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Pcsk9Q80W65 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Pcsk9Q80W65 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Pcsk9Q80W65 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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