Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap100Q80VN0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap100Q80VN0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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