Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

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Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Pnma8aQ80VM8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Pnma8aQ80VM8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Pnma8aQ80VM8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Pnma8aQ80VM8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pnma8aQ80VM8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma8aQ80VM8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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