Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpp38Q80UU2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms