Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1cQ7TSF0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms