Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nphp3Q7TNH6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms