Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMS5

Abcg2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg2Q7TMS5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Abcg2Q7TMS5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms