Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Scn4bQ7M729 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Scn4bQ7M729 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Scn4bQ7M729 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Scn4bQ7M729 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Scn4bQ7M729 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Scn4bQ7M729 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Scn4bQ7M729 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Scn4bQ7M729 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Scn4bQ7M729 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn4bQ7M729 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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