Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Trappc6aQ78XR0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Trappc6aQ78XR0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Trappc6aQ78XR0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Trappc6aQ78XR0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc6aQ78XR0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Trappc6aQ78XR0 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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