Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms