Protein–RNA interactions for Protein: Q78TU8

Fam107a, Family with sequence similarity 107, member A, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107aQ78TU8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Fam107aQ78TU8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Fam107aQ78TU8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Fam107aQ78TU8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam107aQ78TU8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam107aQ78TU8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam107aQ78TU8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam107aQ78TU8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam107aQ78TU8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam107aQ78TU8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam107aQ78TU8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam107aQ78TU8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam107aQ78TU8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Fam107aQ78TU8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam107aQ78TU8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam107aQ78TU8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam107aQ78TU8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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