Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rpl35Q6ZWV7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rpl35Q6ZWV7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rpl35Q6ZWV7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rpl35Q6ZWV7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rpl35Q6ZWV7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rpl35Q6ZWV7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms