Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Topbp1Q6ZQF0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms