Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ssxb3Q6XAS4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ssxb3Q6XAS4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ssxb3Q6XAS4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssxb3Q6XAS4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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