Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc44a1Q6X893 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms