Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms