Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms