Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Q4

Fhod1, FH1/FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhod1Q6P9Q4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fhod1Q6P9Q4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms