Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gga2Q6P5E6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gga2Q6P5E6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gga2Q6P5E6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gga2Q6P5E6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gga2Q6P5E6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gga2Q6P5E6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms