Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2B1

Tnpo3, Transportin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo3Q6P2B1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnpo3Q6P2B1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnpo3Q6P2B1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnpo3Q6P2B1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnpo3Q6P2B1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnpo3Q6P2B1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnpo3Q6P2B1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnpo3Q6P2B1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnpo3Q6P2B1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnpo3Q6P2B1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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