Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms