Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9bQ6EBV9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms