Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms