Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms