Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Top2bQ64511 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms