Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PtprdQ64487 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PtprdQ64487 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PtprdQ64487 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PtprdQ64487 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PtprdQ64487 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PtprdQ64487 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PtprdQ64487 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PtprdQ64487 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PtprdQ64487 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PtprdQ64487 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PtprdQ64487 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PtprdQ64487 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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PtprdQ64487 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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PtprdQ64487 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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