Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms