Protein–RNA interactions for Protein: Q640N2

Arl13b, ADP-ribosylation factor-like protein 13B, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl13bQ640N2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arl13bQ640N2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl13bQ640N2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl13bQ640N2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl13bQ640N2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl13bQ640N2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl13bQ640N2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl13bQ640N2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl13bQ640N2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl13bQ640N2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl13bQ640N2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl13bQ640N2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl13bQ640N2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl13bQ640N2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl13bQ640N2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms