Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms