Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms