Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Cd180Q62192 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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