Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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AtrxQ61687 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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AtrxQ61687 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms