Protein–RNA interactions for Protein: Q61521

Ereg, Proepiregulin, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EregQ61521 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EregQ61521 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EregQ61521 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EregQ61521 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EregQ61521 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EregQ61521 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EregQ61521 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EregQ61521 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EregQ61521 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EregQ61521 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EregQ61521 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EregQ61521 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EregQ61521 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EregQ61521 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EregQ61521 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EregQ61521 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EregQ61521 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EregQ61521 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EregQ61521 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EregQ61521 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EregQ61521 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EregQ61521 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EregQ61521 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EregQ61521 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EregQ61521 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EregQ61521 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EregQ61521 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EregQ61521 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EregQ61521 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EregQ61521 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EregQ61521 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EregQ61521 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EregQ61521 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EregQ61521 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EregQ61521 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EregQ61521 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EregQ61521 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EregQ61521 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EregQ61521 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EregQ61521 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EregQ61521 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EregQ61521 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EregQ61521 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EregQ61521 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EregQ61521 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EregQ61521 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EregQ61521 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EregQ61521 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EregQ61521 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EregQ61521 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EregQ61521 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EregQ61521 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EregQ61521 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EregQ61521 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EregQ61521 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EregQ61521 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EregQ61521 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EregQ61521 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EregQ61521 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EregQ61521 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EregQ61521 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EregQ61521 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EregQ61521 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EregQ61521 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EregQ61521 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EregQ61521 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EregQ61521 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EregQ61521 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EregQ61521 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EregQ61521 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EregQ61521 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EregQ61521 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EregQ61521 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EregQ61521 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EregQ61521 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EregQ61521 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EregQ61521 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EregQ61521 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EregQ61521 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EregQ61521 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EregQ61521 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EregQ61521 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EregQ61521 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EregQ61521 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EregQ61521 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EregQ61521 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EregQ61521 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EregQ61521 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EregQ61521 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EregQ61521 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EregQ61521 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EregQ61521 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EregQ61521 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EregQ61521 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EregQ61521 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EregQ61521 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EregQ61521 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EregQ61521 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EregQ61521 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EregQ61521 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms