Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms