Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms