Protein–RNA interactions for Protein: Q61035

Hars, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HarsQ61035 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HarsQ61035 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HarsQ61035 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HarsQ61035 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HarsQ61035 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HarsQ61035 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HarsQ61035 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HarsQ61035 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HarsQ61035 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HarsQ61035 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HarsQ61035 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HarsQ61035 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HarsQ61035 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HarsQ61035 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HarsQ61035 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HarsQ61035 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HarsQ61035 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HarsQ61035 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HarsQ61035 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HarsQ61035 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HarsQ61035 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms