Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
JrkQ60976 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
JrkQ60976 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
JrkQ60976 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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JrkQ60976 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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JrkQ60976 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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JrkQ60976 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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JrkQ60976 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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JrkQ60976 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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JrkQ60976 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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JrkQ60976 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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JrkQ60976 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
JrkQ60976 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
JrkQ60976 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms