Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbbp4Q60972 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms