Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Neurod1Q60867 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms